原來DNA定序還有別的方法

上午結束了本學期最後一堂族群遺傳學,
老師說10:00有兩個演講, 建議大家去聽聽, 吸收新知.

不知道是下午的seminar混淆我的視聽, 還是記性太差,
我只記得其中一個演講的大致內容,
他是用DNA定序的方式, 檢測糖尿病患者常見的潰爛傷口裡的細菌相, 試圖找出致病的細菌.
他提到研究使用pyrosequencing的技術.

由於平常都比較偏向接觸生態方面的資訊, 搞不清楚這是什麼, 所以請教了google大師.
原來pyrosequencing是一種可以處理大量sample的技術, 適用於定序較短的片段,
大多用來檢測SNP!!
詳細的原理文字說明與精彩影片, 請看 http://www.biotagebio.com/DynPage.aspx?id=7454

早在N年前的科學人裡的一篇文章 {1000美元解開你的基因} http://sa.ylib.com/read/readshow.asp?FDocNo=802&DocNo=1299,
也有小提一下這個技術, 還虧我也看過這一篇...

不過還是有其他定序方法喔!! 比如說這一個http://tw.youtube.com/watch?v=bFNjxKHP8Jc
相關的資訊也可以參考http://hysoff.blogspot.com/search/label/454%20LifeScience

還有這個技術, 只要一個DNA片段就可以進行定序,
不用再耗費等待PCR的漫長時間 http://tw.youtube.com/watch?v=TboL7wODBj4

看完這些內容, 有種很感動的感覺, 今天又學到一個新東西囉!!

口試前的焦慮

打混了好幾天,終於在下午完成了論文的ppt
54頁的份量,要壓縮在30分鐘內結束有些困難
已經捨棄很多東西沒詳細講了
練習了2次,還是要耗費32分鐘
沒關係吧! 明天老師還會再看過,說不定還有要刪除的部份

ppt暫時完成之後,有種不知道要做什麼的感覺
想著明天要準備的東西--水果、伴手禮、餐廳訂位
大概記下這些瑣事之後,改做一個好像很重要又不重要的事
把之前保存的菜蛤組織標本逐一換成95%酒精
據說這樣的DNA或組織可以保存的比較久
換完100隻樣本,剩下的改天再繼續吧!
大概還有將近2週的時間會待在彰化

週二口試結束後,要盡快修改好論文
論文上傳、印製、辦理離校手續、整理家裡和實驗室的書堆
建立實驗室分生用品的清單 (畢竟目前沒人要接手分生實驗)
整理好我所有的貝類標本,把該弄的東西都處理好~
回台北之前,要再去台中舅舅家、科博館、要去見諸羅樹蛙一面
回台北之後,要去一年不見的平溪,要跟好久不見的朋友們打個招呼

接下來就是嶄新的生活了
不一樣的環境,應該會有更多的刺激,催促自己進步向上的動力
先給自己一個目標--把碩士期間的研究寫成paper,今年底前投稿!
未來的研究計畫,大概有個雛形了,今年底前也要更明確!
加油吧!! 希望口試前的焦慮能改快消除~

論文初稿完成!!

歷經2日的不正常作息與24小時趕工
我的論文初稿終於在7/9及時完成
腰圍也在寫論文期間增加一圈(至少我"抓"得起一圈)
還好有實驗室夥伴的一同加油
不然現在可能還在趕論文!

昨天論文初稿印製完成後,先寄了一本給未來的老師
之後就大大鬆了一口氣~ 接下來就只剩口試了!
希望那天不會有什麼大問題~
晚上回家,原本還想說來看個恐怖片 輕鬆一下
但實在是太睏了! 從晚上9點睡到今天早上10點多
嘖嘖~ 熬夜實在是有夠不划算!
沒事的話,還是保持正常作息最好.

今天特地跑去蓮華池送初稿給口委
也順便來個夜間觀察
已經很久很久沒出野外了,要抓回這快被遺忘的熟悉感
可能是下雨的緣故,今天青蛙有夠少,蝸牛種類也很少
大部分都看到某鱉甲蝸牛,顯見這裏的數量應該非常多!
陸生渦蟲也看到3隻,最值回票價的是看到螢火蟲!

回程時,跑去小台化享用好吃的肉羹麵和蚵仔煎!
現在都還覺得很飽! 哈哈~
明天再開始做ppt吧!